10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0400 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  80.43 
 
 		 968 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  80.43 
 
 		 968 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  77.9 
 
 		 922 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0434  hypothetical protein  58.08 
 
 		 508 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  100 
 
 		 845 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  92.19 
 
 		 215 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  44.16 
 
 		 1003 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  42.31 
 
 		 1000 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  52.24 
 
 		 868 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>