More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3942 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 138 aa  267  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  68.64 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  66.95 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  66.95 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  66.39 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  68.33 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  56 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  53.44 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  55.14 
 
 		 205 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  46.22 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 124 aa  93.6  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  48.74 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  44.17 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  41.22 
 
 		 480 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  42.02 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  35.14 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  35.45 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  34.68 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  34.68 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  32.73 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  38.24 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  39.66 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  38.18 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  32.98 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.93 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>