More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4587 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 394 aa  94.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  41.67 
 
 		 402 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 136 aa  84.3  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  46.73 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  39.37 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  39.37 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  39.37 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  41.8 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  37.17 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  39.02 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  33.93 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_003296  RS03190  lipoprotein  38.1 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  37.29 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  37.29 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  39.84 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  35.66 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  36.61 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  36.61 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  40.3 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  36.07 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  38.21 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  42.19 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  36.07 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  36.29 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  34.96 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  35.88 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>