More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0230 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  100 
 
 
135 aa  273  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  73.55 
 
 
129 aa  178  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  69.42 
 
 
128 aa  167  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  63.93 
 
 
123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  63.64 
 
 
126 aa  156  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  66.94 
 
 
124 aa  155  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  59.32 
 
 
127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  61.16 
 
 
125 aa  154  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  57.85 
 
 
126 aa  154  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  57.85 
 
 
126 aa  153  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
125 aa  152  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 
143 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  59.5 
 
 
126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 
129 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  61.86 
 
 
124 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  62.71 
 
 
124 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 
126 aa  148  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  61.16 
 
 
129 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 
125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  60.16 
 
 
125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 
126 aa  144  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 
124 aa  143  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  54.84 
 
 
126 aa  143  9e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
126 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 
127 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 
127 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 
124 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
126 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  57.5 
 
 
124 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  57.5 
 
 
124 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  58.33 
 
 
127 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 
124 aa  140  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  58.33 
 
 
124 aa  140  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  58.33 
 
 
124 aa  140  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 
124 aa  140  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 
124 aa  140  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 
124 aa  140  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
126 aa  140  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 
124 aa  140  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  50.41 
 
 
126 aa  140  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  57.26 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 
140 aa  137  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  56.78 
 
 
124 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  52.03 
 
 
126 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 
131 aa  135  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 
126 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
128 aa  135  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 
126 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
128 aa  135  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 
126 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  57.72 
 
 
126 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
128 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 
125 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
126 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 
125 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
128 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 
141 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 
124 aa  134  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 
141 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
128 aa  134  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  51.2 
 
 
128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  51.2 
 
 
128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  53.66 
 
 
126 aa  133  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 
128 aa  133  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 
126 aa  133  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
127 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
127 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  50.81 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  53.72 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  50.4 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  52.38 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
127 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 
125 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  60.66 
 
 
133 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  54.17 
 
 
126 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
125 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
127 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  48 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>