More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2961 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 138 aa  288  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  96.35 
 
 		 138 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  94.89 
 
 		 138 aa  273  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  92.03 
 
 		 145 aa  271  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  93.38 
 
 		 139 aa  269  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  89.71 
 
 		 140 aa  263  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  89.71 
 
 		 140 aa  263  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  87.5 
 
 		 145 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  96.12 
 
 		 130 aa  258  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  87.5 
 
 		 144 aa  259  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  87.5 
 
 		 145 aa  258  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  89.63 
 
 		 145 aa  258  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  86.76 
 
 		 145 aa  258  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  86.76 
 
 		 145 aa  258  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  86.03 
 
 		 149 aa  258  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  88.15 
 
 		 145 aa  256  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  86.67 
 
 		 138 aa  255  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  88.15 
 
 		 145 aa  256  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  85.29 
 
 		 136 aa  251  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  63.97 
 
 		 140 aa  185  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  63.43 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  64.39 
 
 		 139 aa  174  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  54.07 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  48.91 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  34.74 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  29.81 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  36.79 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 394 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  29.23 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  29.23 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  35.78 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  33.98 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  35.78 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  38.53 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 402 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  28.44 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  38.95 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  35.19 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  32.73 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  37.04 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>