More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1663 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  82.22 
 
 		 149 aa  224  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  75.74 
 
 		 140 aa  213  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  73.68 
 
 		 137 aa  205  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  67.41 
 
 		 140 aa  190  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  67.41 
 
 		 140 aa  190  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  67.67 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  67.67 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  65.22 
 
 		 145 aa  187  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  65.67 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  66.18 
 
 		 145 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  63.97 
 
 		 138 aa  185  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  65.67 
 
 		 145 aa  185  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  64.93 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  63.7 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  64.93 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  64.71 
 
 		 145 aa  183  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  63.24 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  62.22 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  68.66 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  60.74 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  62.7 
 
 		 130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  61.31 
 
 		 139 aa  159  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  36.21 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  30.53 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  30.53 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  38.18 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  33.04 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  37.27 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  38.53 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  33.04 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  36.94 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  40 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  36.45 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  39.81 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  38.53 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  31.78 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  32.38 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  37.04 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  28.68 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  29.1 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>