More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0725 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 136 aa  274  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  68.42 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  64.39 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  63.85 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 135 aa  167  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  64.89 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  53.44 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  50.86 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  45.59 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  46.27 
 
 		 133 aa  95.9  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  45.26 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  41.67 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  42.64 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  40.15 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  38.46 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  39.68 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  31.3 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  30.83 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  40.62 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  31.85 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  37.4 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  37.4 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  39.84 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  37.12 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  37.3 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  39.69 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  39.84 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  37.12 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  39.69 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  39.69 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  39.69 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  39.84 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  39.85 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  39.53 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  39.69 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>