More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3010 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  67.67 
 
 		 135 aa  183  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  66.92 
 
 		 133 aa  177  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  63.28 
 
 		 137 aa  170  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  66.15 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  63.85 
 
 		 136 aa  168  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  52.24 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  39.55 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  44.96 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  35.34 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  34.09 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  40.74 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  34.11 
 
 		 130 aa  87  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  40.44 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  40.46 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  37.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  38.58 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  43.1 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  40.16 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  40.16 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  41.73 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  37.78 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  39.06 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  39.37 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  36.57 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  38.58 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  35.38 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  42.59 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  35.82 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  36.22 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>