More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0942 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
128 aa  259  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  62.9 
 
 
126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  67.48 
 
 
126 aa  161  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  57.94 
 
 
126 aa  160  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  63.71 
 
 
126 aa  157  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 
132 aa  157  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 
122 aa  150  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 
124 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 
125 aa  147  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  61.79 
 
 
125 aa  147  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
126 aa  144  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
126 aa  143  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 
122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
140 aa  141  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  141  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 
143 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 
227 aa  139  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
127 aa  138  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 
126 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 
126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  49.61 
 
 
130 aa  137  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  53.54 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
128 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 
123 aa  136  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
125 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
127 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  50.82 
 
 
126 aa  135  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
125 aa  135  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 
131 aa  134  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
126 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  51.56 
 
 
130 aa  134  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
126 aa  134  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
127 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
126 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  50 
 
 
129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  49.18 
 
 
126 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
125 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
125 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  51.64 
 
 
135 aa  133  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
129 aa  133  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
124 aa  131  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
126 aa  131  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
127 aa  131  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 
125 aa  131  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 
124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  50.81 
 
 
126 aa  130  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
124 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
126 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  50.79 
 
 
128 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 
130 aa  130  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 
124 aa  130  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
126 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  49.19 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 
150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 
130 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
125 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  46.46 
 
 
130 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  49.59 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  49.59 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
141 aa  127  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 
134 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  48.76 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
129 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 
124 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  48.78 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  46.4 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
128 aa  124  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  44.09 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>