More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1694 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 124 aa  253  6e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 		 124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 		 126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 126 aa  157  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  58.06 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  57.26 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  57.26 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 124 aa  149  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  60.16 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  57.98 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 124 aa  143  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  53.78 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  57.5 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  53.23 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  56.91 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  54.76 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  53.23 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  51.24 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  50.41 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  48.36 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  52.1 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  50.81 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  52 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  55.26 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  48.8 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  48.74 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  53.51 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 227 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>