More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2931 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
129 aa  251  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  83.72 
 
 
133 aa  212  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 
126 aa  124  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 
127 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 
125 aa  123  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
127 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 
125 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
143 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
131 aa  114  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
126 aa  115  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
125 aa  114  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
124 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 
124 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  48.76 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  47.15 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
126 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 
124 aa  110  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  48.36 
 
 
127 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 
125 aa  110  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 
126 aa  110  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  41.41 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  48 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  44.53 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  42.62 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  42.62 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 
124 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  44.62 
 
 
130 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  47.2 
 
 
129 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 
129 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 
133 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
128 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 
126 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 
124 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  45.38 
 
 
130 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 
126 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 
126 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 
126 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  43.08 
 
 
130 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  44.72 
 
 
129 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 
129 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 
124 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 
126 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  45.04 
 
 
130 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  46.61 
 
 
126 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  44.54 
 
 
128 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 
141 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 
124 aa  104  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  44.26 
 
 
126 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  44.54 
 
 
128 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  46.61 
 
 
126 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  45.04 
 
 
131 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 
124 aa  104  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  45.04 
 
 
131 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 
126 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 
126 aa  104  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  46.4 
 
 
132 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 
126 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 
126 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  45.53 
 
 
126 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
126 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 
129 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 
129 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 
135 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
126 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 
124 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
127 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  45.16 
 
 
124 aa  102  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
126 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
126 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 
129 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 
125 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  47.66 
 
 
129 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 
128 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  41.86 
 
 
135 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 
129 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  43.44 
 
 
126 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 
127 aa  101  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 
127 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  42.74 
 
 
126 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 
124 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 
130 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 
127 aa  100  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>