More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0815 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 140 aa  146  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  51.61 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 125 aa  137  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  52.85 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  51.94 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  52.89 
 
 		 135 aa  136  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  51.22 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  50.39 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  50.41 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  47.24 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  52.76 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  53.17 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  54.62 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  49.59 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  52.14 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  48.74 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  48.8 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  46.46 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  48.8 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 128 aa  129  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  48.03 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  51.59 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  52.42 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  45.16 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  50.79 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  46.03 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  48.39 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  46.4 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  46.77 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>