More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2009 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  263  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  74.8 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  71.65 
 
 		 127 aa  190  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  70.87 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  70.73 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  69.11 
 
 		 126 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  68.29 
 
 		 126 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  68.29 
 
 		 126 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  68.29 
 
 		 126 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  69.11 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  64.84 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  68.29 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  68.29 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  67.48 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  68.29 
 
 		 126 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  67.48 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  67.48 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  64.75 
 
 		 128 aa  167  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  65.32 
 
 		 128 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  66.12 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  62.3 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  60.94 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  63.41 
 
 		 127 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  63.87 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  61.16 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  63.03 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  63.87 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  60.98 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  58.54 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  61.34 
 
 		 127 aa  153  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  61.34 
 
 		 127 aa  151  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  58.54 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  59.32 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 128 aa  150  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  58.47 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  61.34 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  55.04 
 
 		 129 aa  146  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  59.66 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  59.17 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  62.6 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  57.26 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  50.4 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  54.4 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  55.93 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  55.93 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  52.89 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 128 aa  129  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  48.84 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  51.61 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  53.17 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  51.18 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>