More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00156 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  79.69 
 
 		 128 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  75.81 
 
 		 127 aa  201  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  75.81 
 
 		 127 aa  200  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  75.81 
 
 		 127 aa  200  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  75.81 
 
 		 127 aa  200  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  76.61 
 
 		 127 aa  201  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  76.61 
 
 		 127 aa  200  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  76.61 
 
 		 127 aa  200  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  75.81 
 
 		 127 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  75 
 
 		 127 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  74.19 
 
 		 127 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  72.58 
 
 		 127 aa  194  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  73.39 
 
 		 127 aa  193  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  70.63 
 
 		 127 aa  193  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  73.39 
 
 		 127 aa  192  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  73.6 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  72.58 
 
 		 127 aa  190  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  72.58 
 
 		 127 aa  190  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  70.16 
 
 		 126 aa  186  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  70.16 
 
 		 126 aa  186  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  70.16 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  69.6 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  69.35 
 
 		 126 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  69.05 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  69.05 
 
 		 126 aa  184  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  68.55 
 
 		 126 aa  183  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  68.25 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  65.08 
 
 		 128 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  66.94 
 
 		 126 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  68.8 
 
 		 128 aa  178  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  67.74 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  64.57 
 
 		 127 aa  176  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  65.32 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  64.29 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  63.93 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  60.16 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  62.6 
 
 		 129 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  61.16 
 
 		 128 aa  167  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  60.33 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  60.94 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  65.35 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  60.94 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  57.81 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  61.29 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 		 126 aa  156  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  58.2 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  62.7 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  52.89 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  52.42 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  60.32 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  53.12 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  53.49 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  53.12 
 
 		 130 aa  136  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  59.52 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 126 aa  133  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  55.08 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  50.85 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  45.16 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 124 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  50.42 
 
 		 125 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  50.42 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>