More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5010 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  262  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  59.06 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  47.29 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  44.35 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  48.33 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  46.9 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  52.78 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  46.67 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  49.17 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  46.77 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 124 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 128 aa  116  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  45.83 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  55.56 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  45.83 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  51.85 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  46.67 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  51.56 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  47.46 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  50.44 
 
 		 135 aa  113  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  48.33 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  46.23 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  46.67 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  43.33 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  43.8 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  47.66 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  46.34 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  47.22 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  42.37 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  45.76 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  46.83 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  43.8 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  43.33 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  41.74 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  43.22 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>