More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2337 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  51.35 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1512  endoribonuclease L-PSP  59.06 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  49.14 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  47.46 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  44.83 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  40.94 
 
 		 127 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  43.1 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  42.98 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  45.13 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  43.1 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  42.24 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  42.24 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  50.49 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  40.52 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  46.73 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  41.13 
 
 		 128 aa  103  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  46.85 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  40.68 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  42.74 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  36.59 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  45.13 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  42.48 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  38.98 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  38.98 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  40.16 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  40.16 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  42.15 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 128 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  40.32 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  42.48 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  40.35 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  39.37 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  44.25 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  43.36 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  43.1 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>