More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2235 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  100 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  83.2 
 
 		 125 aa  210  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  66.94 
 
 		 127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  66.94 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  63.64 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  65.35 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  60.98 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  63.64 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  61.9 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  68.29 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  60.32 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  57.98 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  60.16 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 125 aa  144  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  56.45 
 
 		 127 aa  141  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  56.45 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  56.45 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  60.16 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  54.76 
 
 		 125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  54.76 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  54.84 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  57.72 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  52.8 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  54.03 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 124 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  55.37 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1401  endoribonuclease L-PSP  61.42 
 
 		 128 aa  129  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190303  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 124 aa  130  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1300  endoribonuclease L-PSP  61.9 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2549  endoribonuclease L-PSP  61.11 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  50.81 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  52.42 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  53.97 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  48 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  52.21 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>