More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1443 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  100 
 
 
124 aa  249  8.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  69.67 
 
 
124 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  62.9 
 
 
124 aa  165  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  59.68 
 
 
124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  61.29 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  61.29 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 
124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  59.68 
 
 
124 aa  160  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  60.48 
 
 
127 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  59.68 
 
 
124 aa  158  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  60.33 
 
 
128 aa  156  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
124 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 
129 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 
124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  60.16 
 
 
131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  51.61 
 
 
126 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 
136 aa  140  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 
124 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  55.74 
 
 
125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
123 aa  135  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  54.03 
 
 
126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
128 aa  131  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  56.1 
 
 
129 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 
144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 
126 aa  130  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
125 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  50.82 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  50.42 
 
 
125 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  51.67 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 
125 aa  124  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 
122 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  55.74 
 
 
130 aa  124  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 
126 aa  124  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 
127 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 
125 aa  123  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 
127 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 
141 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
126 aa  123  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  50 
 
 
131 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  51.2 
 
 
132 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
130 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  48.31 
 
 
127 aa  121  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 
126 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
127 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
125 aa  120  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  45.08 
 
 
133 aa  121  4e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  50 
 
 
128 aa  120  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
127 aa  120  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  52.94 
 
 
128 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  47.2 
 
 
127 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
126 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
128 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
129 aa  120  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 
227 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  54.87 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
125 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 
126 aa  117  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 
130 aa  117  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  53.98 
 
 
120 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
124 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
122 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  47.58 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  46.77 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  47.46 
 
 
130 aa  114  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>