More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1054 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
126 aa  253  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
126 aa  253  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  99.21 
 
 
126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 
125 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 
124 aa  140  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  54.84 
 
 
125 aa  139  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
126 aa  138  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  53.23 
 
 
135 aa  136  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
127 aa  136  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
124 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  53.23 
 
 
126 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
140 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
143 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 
124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  53.23 
 
 
126 aa  130  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
132 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
126 aa  128  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  49.21 
 
 
126 aa  128  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
129 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  51.22 
 
 
135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 
135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
124 aa  127  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
128 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
124 aa  126  9.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
127 aa  126  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 
126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  53.45 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  53.33 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  47.93 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 
227 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
126 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  50.81 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  51.56 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
127 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  50 
 
 
124 aa  123  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  123  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
126 aa  123  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
129 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
126 aa  122  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
126 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  50.41 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  50.41 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
127 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 
128 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  50.83 
 
 
124 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
126 aa  122  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
130 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
144 aa  122  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  45.97 
 
 
127 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 
128 aa  121  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  49.59 
 
 
156 aa  121  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  49.6 
 
 
132 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  46.83 
 
 
126 aa  121  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 
126 aa  121  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  120  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  51.72 
 
 
120 aa  121  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 
120 aa  120  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
124 aa  120  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
125 aa  120  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
126 aa  120  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  50 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 
124 aa  118  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
128 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>