More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0965 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
141 aa  287  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  85.27 
 
 
129 aa  221  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  75.76 
 
 
132 aa  203  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  62.99 
 
 
135 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  62.99 
 
 
135 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  62.5 
 
 
132 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  63.57 
 
 
130 aa  159  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  55.91 
 
 
130 aa  156  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  56.59 
 
 
130 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 
131 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 
131 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  55.2 
 
 
130 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 
125 aa  147  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  53.08 
 
 
227 aa  144  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  57.48 
 
 
131 aa  144  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  59.69 
 
 
128 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  54.26 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  56.49 
 
 
134 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 
129 aa  133  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 
130 aa  133  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 
132 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 
140 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  53.28 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 
128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 
125 aa  130  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
126 aa  130  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 
128 aa  129  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
128 aa  127  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 
129 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  50.39 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 
127 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  49.22 
 
 
126 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
124 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
124 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  50.4 
 
 
124 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  50.4 
 
 
124 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  124  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
124 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
124 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
126 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 
130 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  47.97 
 
 
126 aa  124  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
124 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
150 aa  124  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
127 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  48.84 
 
 
127 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  52.03 
 
 
126 aa  123  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 
126 aa  123  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
129 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
124 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  123  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
124 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 
129 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  52.8 
 
 
124 aa  122  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 
126 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
124 aa  122  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 
126 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  46.72 
 
 
125 aa  121  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  51.56 
 
 
156 aa  121  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 
127 aa  121  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
124 aa  120  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
126 aa  120  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 
124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  49.22 
 
 
130 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
126 aa  117  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
128 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
129 aa  117  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
124 aa  116  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  47.29 
 
 
127 aa  116  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>