More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3444 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  63.93 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  60.32 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  61.9 
 
 		 133 aa  157  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  56.45 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 127 aa  153  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 143 aa  153  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  59.02 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  56.59 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  51.2 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 123 aa  137  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  48 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  55.46 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  54.55 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  51.94 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  52.34 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  51.94 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  49.18 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  53.17 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  53.6 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  48.84 
 
 		 227 aa  130  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 125 aa  130  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 		 129 aa  129  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  53.39 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  55.46 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  50.4 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  48.44 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  49.19 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  49.19 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  54.4 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  47.66 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 128 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  51.67 
 
 		 125 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  47.29 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  47.29 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  47.29 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>