More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3210 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  250  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  96.85 
 
 		 127 aa  243  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  66.94 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  67.74 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 127 aa  147  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  54.33 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  51.56 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  51.22 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  51.64 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  52.38 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  51.56 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  49.59 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  53.49 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  49.6 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  48.84 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 		 227 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  48 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  52.76 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  44.26 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  47.2 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  48.06 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  49.59 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  46.34 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  47.54 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  47.54 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  47.54 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>