More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1134 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  253  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 125 aa  151  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  59.5 
 
 		 129 aa  146  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  57.94 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 125 aa  143  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  50.41 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  52.46 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  51.61 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  48.33 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  56.3 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  50.82 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  48.41 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  44.44 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  50.41 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  49.59 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  55.74 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  49.59 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  54.1 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  47.97 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  47.15 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  54.26 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  50.4 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  51.64 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  48.78 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  49.6 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  53.66 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  45.6 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  47.15 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  50.81 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  50.81 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  46.28 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  46.4 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>