More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3008 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  76.86 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  64.52 
 
 		 128 aa  159  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  61.16 
 
 		 135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  60.8 
 
 		 126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  60 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  60 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  59.17 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  58.06 
 
 		 127 aa  150  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  58.14 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  55.93 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 125 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  51.24 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  54.1 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  50.85 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  52.5 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  55.81 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  52.21 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  52.21 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  52.71 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  57.36 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  50.78 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  52.85 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  50.82 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  48.03 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  48.36 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  51.59 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  51.22 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>