More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_8140 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  100 
 
 
131 aa  259  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 
131 aa  136  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 
136 aa  135  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 
127 aa  130  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 
125 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 
124 aa  128  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 
129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
127 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  52.42 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
126 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
125 aa  122  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  50.39 
 
 
130 aa  122  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
129 aa  122  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  53.72 
 
 
127 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  50 
 
 
124 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 
130 aa  121  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 
124 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 
126 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
126 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
127 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  47.29 
 
 
130 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 
127 aa  120  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
126 aa  120  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  50.81 
 
 
126 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 
128 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
132 aa  119  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  48.03 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
126 aa  118  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
126 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  47.29 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 
130 aa  117  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  47.15 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  51.24 
 
 
128 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 
125 aa  114  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 
129 aa  114  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  50.41 
 
 
128 aa  114  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  46.28 
 
 
130 aa  114  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 
124 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  44.63 
 
 
133 aa  114  5e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
126 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 
124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 
125 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 
124 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
125 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  48 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  44.26 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  44.26 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  48.84 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  46.28 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  44.8 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  49.19 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 
227 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
122 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 
143 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  46.09 
 
 
132 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
128 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  49.59 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  44.26 
 
 
127 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 
124 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 
124 aa  110  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
126 aa  110  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
127 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
127 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
126 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
128 aa  110  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  44.09 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>