More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0614 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  257  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  60.32 
 
 		 127 aa  167  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  60.33 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 		 125 aa  163  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  59.52 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  50.39 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  52.76 
 
 		 126 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 126 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  50.39 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  54.33 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  49.21 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  52.42 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  53.28 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 128 aa  144  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 124 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  56.59 
 
 		 132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  51.18 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 128 aa  143  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  53.23 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  53.23 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  53.72 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  55.56 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 126 aa  141  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  53.23 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  48.39 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  54.03 
 
 		 125 aa  141  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 124 aa  141  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  52 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  50.39 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  50.41 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  56.1 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  56.1 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>