More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2593 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
126 aa  253  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 
126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  60.98 
 
 
143 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  65.85 
 
 
133 aa  158  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 
127 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 
125 aa  153  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 
126 aa  153  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 
126 aa  153  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  59.84 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 
125 aa  147  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 
126 aa  146  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
126 aa  146  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 
129 aa  146  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  57.14 
 
 
129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 
129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 
128 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 
124 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 
128 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  54.92 
 
 
127 aa  144  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 
124 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  57.14 
 
 
129 aa  143  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
124 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  54.84 
 
 
124 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  54.84 
 
 
124 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 
126 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 
124 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
124 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
124 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
140 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 
124 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  56.35 
 
 
128 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
124 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
124 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 
128 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 
127 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
124 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
126 aa  141  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 
127 aa  141  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 
128 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  54.55 
 
 
135 aa  140  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 
128 aa  140  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 
125 aa  140  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 
124 aa  140  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  58.54 
 
 
128 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  58.54 
 
 
128 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 
128 aa  140  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 
128 aa  140  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 
125 aa  140  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 
124 aa  140  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 
128 aa  140  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  54.03 
 
 
127 aa  139  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  52.85 
 
 
125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  55 
 
 
125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  53.49 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  54.76 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  54.1 
 
 
126 aa  138  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 
126 aa  137  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
126 aa  135  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 
128 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  48.41 
 
 
151 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 
122 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
130 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
125 aa  134  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 
124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
123 aa  133  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  52.94 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  49.6 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
128 aa  131  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0543  putative endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>