More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0109 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 
126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 
127 aa  153  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  58.4 
 
 
127 aa  153  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  59.2 
 
 
128 aa  153  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 
125 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
126 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  55.3 
 
 
143 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  58.91 
 
 
128 aa  150  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  60.83 
 
 
128 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 
126 aa  149  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 
126 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 
126 aa  148  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 
132 aa  146  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  56.1 
 
 
126 aa  144  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 
126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 
125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 
125 aa  144  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 
129 aa  143  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 
129 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 
125 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
126 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
128 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
127 aa  140  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 
126 aa  140  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  58.82 
 
 
124 aa  140  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
126 aa  137  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  57.98 
 
 
124 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  58.06 
 
 
135 aa  137  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
127 aa  136  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 
128 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 
124 aa  136  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 
126 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  57.26 
 
 
125 aa  136  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 
129 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
125 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 
130 aa  136  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 
129 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  54.76 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  49.61 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  52.76 
 
 
128 aa  134  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  53.39 
 
 
128 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  51.22 
 
 
151 aa  134  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  51.33 
 
 
128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  57.5 
 
 
124 aa  133  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 
127 aa  133  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  56.9 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  56.9 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  56.9 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  50.44 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  51.22 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  56.9 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  56.9 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  56.9 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  53.28 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  56.52 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 
124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  52.03 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  54.78 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  56.64 
 
 
131 aa  131  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
126 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 
127 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 
126 aa  131  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  52.31 
 
 
132 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 
141 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
126 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  54.7 
 
 
124 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
130 aa  131  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
125 aa  131  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 
124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
151 aa  130  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  53.45 
 
 
123 aa  130  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  53.51 
 
 
126 aa  130  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
126 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  56.14 
 
 
124 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
128 aa  129  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  50.81 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  54.7 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  51.22 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  49.59 
 
 
126 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  52.14 
 
 
128 aa  127  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 
126 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0281593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>