More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2549 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2549  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  253  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1401  endoribonuclease L-PSP  97.66 
 
 		 128 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1300  endoribonuclease L-PSP  96.09 
 
 		 128 aa  214  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  70.31 
 
 		 128 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  61.11 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  57.48 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  60.32 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  60.66 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  55.65 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  57.81 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  54.33 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  58.4 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  57.02 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 136 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  60.16 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  54.69 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  51.56 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  59.2 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  55.2 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  50.39 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  50.39 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  50.79 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  54.33 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  52.34 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  50.39 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  50 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  52.03 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  52.03 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  56.35 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  52.03 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  48.39 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  49.61 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  51.2 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  48.82 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  52 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  48.82 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>