More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4079 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  95.28 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  77.17 
 
 		 127 aa  203  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  71.2 
 
 		 126 aa  177  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  60.8 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  57.26 
 
 		 148 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  55.91 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  54.84 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  55.91 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 129 aa  140  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 127 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  56.8 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  53.54 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  52.76 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  56.35 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  54.33 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  54.7 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  52.42 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  52.42 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  52.42 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  54.84 
 
 		 135 aa  126  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  53.72 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  52.03 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  51.59 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  48.39 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  52.8 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  48.78 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  48.46 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  49.61 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>