More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0176 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 
124 aa  147  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 
124 aa  147  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
124 aa  144  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
124 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
124 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
124 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  54.55 
 
 
124 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  54.55 
 
 
124 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
124 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
124 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
124 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  54.55 
 
 
127 aa  140  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  55.46 
 
 
128 aa  138  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 
125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
125 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 
129 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
126 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 
124 aa  130  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 
130 aa  130  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  48.76 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 
128 aa  127  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 
140 aa  127  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  51.67 
 
 
135 aa  126  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  54.47 
 
 
128 aa  124  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  50.41 
 
 
124 aa  124  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  124  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  50.41 
 
 
156 aa  124  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  53.72 
 
 
126 aa  123  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 
126 aa  123  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  49.19 
 
 
126 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
127 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
127 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
126 aa  121  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 
123 aa  121  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 
126 aa  121  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
126 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
126 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
127 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
128 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 
126 aa  120  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  45.83 
 
 
130 aa  120  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  120  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  48.36 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  50.41 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
124 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
127 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
143 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 
126 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 
128 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  47.58 
 
 
128 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
129 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
127 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
128 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  48.31 
 
 
124 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  47.11 
 
 
125 aa  117  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 
125 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  52.38 
 
 
132 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  42.86 
 
 
130 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  51.2 
 
 
129 aa  116  9e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
141 aa  116  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  43.9 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  43.65 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  45.67 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  45.16 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  45.9 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  45.9 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  47.54 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
128 aa  114  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 
135 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  48.78 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>