More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0734 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 123 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  51.64 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 124 aa  121  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  45.08 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 128 aa  119  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  47.54 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  47.54 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 128 aa  119  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  47.54 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  47.62 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  47.62 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  45.67 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  48.31 
 
 		 128 aa  116  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  46.72 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  49.19 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  49.19 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  47.93 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  48.36 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  44.63 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  45.45 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>