More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1300 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  100 
 
 		 130 aa  266  5.9999999999999995e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  52.89 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  49.6 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  47.24 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  46.72 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  46.46 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 144 aa  116  7.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  44.88 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  44.88 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  46.28 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  45.9 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  46.77 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  47.46 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  45.53 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 227 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  43.65 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  43.75 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  44.09 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  43.09 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  45.9 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  45.61 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  43.55 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  43.2 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  45 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  44.72 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  44.07 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 		 130 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  43.33 
 
 		 126 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 126 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  45 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>