More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1288 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  100 
 
 		 128 aa  256  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  63.64 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  61.24 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  61.98 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  59.69 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  141  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  59.06 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 125 aa  137  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 		 127 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  61.42 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  59.66 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  59.5 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  54.33 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  54.03 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  54.03 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 125 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  48.41 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  54.47 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  53.39 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  58.27 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  48.36 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  52.89 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  52.46 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  55.46 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 125 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  51.2 
 
 		 135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  54.33 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  51.22 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  55.08 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  51.69 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  52.85 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 125 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  52.03 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  55.37 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  51.24 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  47.97 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  52.94 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  55.46 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>