More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0463 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  260  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  56.3 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  50 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  47.54 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  46.77 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  47.58 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  48.74 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  51.64 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  47.9 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  48.31 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  53.28 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  50.42 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  43.09 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  50.85 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  50.85 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  40.62 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  41.73 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  42.86 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  47.58 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  40.98 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  46.61 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  45.38 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 151 aa  106  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  40 
 
 		 124 aa  106  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  47.2 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 127 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  44.17 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  44.07 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  44.92 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  43.8 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  41.32 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>