More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_05611 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  100 
 
 
132 aa  268  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  62.88 
 
 
132 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  62.6 
 
 
135 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  61.83 
 
 
135 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  62.2 
 
 
129 aa  175  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  62.5 
 
 
141 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  58.14 
 
 
130 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  56.59 
 
 
130 aa  153  9e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  55.81 
 
 
130 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  57.14 
 
 
130 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  54.69 
 
 
131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  54.69 
 
 
131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  50 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  51.54 
 
 
130 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  51.56 
 
 
130 aa  136  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 
130 aa  134  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 
131 aa  134  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  54.03 
 
 
128 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 
227 aa  131  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 
129 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
126 aa  124  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 
134 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
125 aa  123  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 
128 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  51.2 
 
 
124 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 
127 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 
127 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 
126 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 
127 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 
127 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 
140 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 
124 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  49.6 
 
 
126 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
129 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  44.88 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 
126 aa  114  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
128 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 
128 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 
124 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 
150 aa  114  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 
126 aa  114  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
124 aa  114  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
125 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  47.2 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
124 aa  111  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
127 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  43.41 
 
 
127 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 
125 aa  110  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 
126 aa  110  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 
127 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  44.36 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 
126 aa  110  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  44 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  44.09 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
124 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 
124 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  43.2 
 
 
127 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  40.8 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  42.86 
 
 
126 aa  106  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 
126 aa  106  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  42.74 
 
 
148 aa  105  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  43.55 
 
 
151 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  41.94 
 
 
126 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 
129 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 
133 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 
125 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 
125 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 
129 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 
151 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 
124 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 
124 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 
124 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  42.4 
 
 
124 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  42.4 
 
 
124 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 
124 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 
124 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  44.62 
 
 
129 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 
129 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 
128 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 
126 aa  104  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  45.24 
 
 
135 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>