More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1873 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  100 
 
 		 151 aa  309  9e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  99.34 
 
 		 151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  83.59 
 
 		 128 aa  215  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  83.06 
 
 		 126 aa  213  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  63.11 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  59.52 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  59.52 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  60.48 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 128 aa  153  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  58.2 
 
 		 127 aa  150  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  55.12 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  55.56 
 
 		 127 aa  150  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  55.91 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  55.91 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  57.94 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  53.54 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  56.67 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  52.76 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 125 aa  141  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  58.54 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  51.61 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  52.42 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  53.33 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  50.81 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  51.18 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  52.89 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  51.18 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  55 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  55 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  52.34 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 143 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  47.93 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  45.67 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  51.22 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  50.85 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  50.83 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 125 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  50.42 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  44.27 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  47.62 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  48.8 
 
 		 129 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  44.44 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>