More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0871 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 150 aa  303  7e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  54.47 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  59.66 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  52.54 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  47.58 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  53.28 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  44 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  47.69 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  51.16 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  52.99 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  44.63 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  51.69 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  48.74 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 128 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  45 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  45 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  49.15 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  46.72 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  46.88 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  46.61 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  47.54 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  46.67 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  50.82 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 131 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  46.02 
 
 		 131 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  45.83 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  46.15 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  44.8 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  45.83 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  48.72 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  44.26 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  50 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1955  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>