More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0603 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  254  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  62.99 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 124 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  62.71 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  59.5 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 126 aa  139  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 125 aa  135  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  51.69 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  52.46 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 124 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  52.89 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  50.83 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  50.41 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  52.07 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 125 aa  130  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 123 aa  130  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  50.81 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  49.18 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  50.4 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  54.24 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  45.67 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  47.24 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  49.6 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  50.4 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  52.07 
 
 		 135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  52 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  47.2 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  50 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1512  endoribonuclease L-PSP  58.72 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  48.8 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  47.58 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  52.03 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  47.58 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  47.58 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  47.41 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  48.33 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  48.33 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  48.31 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  48.74 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>