More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3374 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  258  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  61.6 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  57.94 
 
 		 128 aa  160  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  59.68 
 
 		 126 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  61.11 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  55.28 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 125 aa  141  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  54.69 
 
 		 227 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  48.44 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  47.62 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  49.18 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  54.26 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  49.18 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  49.18 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  49.22 
 
 		 132 aa  130  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  51.22 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  50.81 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  49.59 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  48.8 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  47.2 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  48.36 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  47.2 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  44.09 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  44.35 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>