More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0414 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 124 aa  249  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  94.35 
 
 		 124 aa  240  5e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  80.8 
 
 		 126 aa  209  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  81.6 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  71.54 
 
 		 126 aa  183  9e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  64 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  61.98 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 128 aa  144  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 125 aa  140  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  56.1 
 
 		 135 aa  137  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 125 aa  137  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  50.79 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  51.94 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 124 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  52.71 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  51.94 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  52 
 
 		 125 aa  131  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  52 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  55.56 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  50.81 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  51.61 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  51.59 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  48.78 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  50.78 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  50.78 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  52.03 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  51.56 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  51.67 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  48.44 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  51.56 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  48.44 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  48.44 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  48.44 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  48.44 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  48.44 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  48.44 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  48.44 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  53.66 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 227 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>