More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0156 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  254  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  62.9 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  59.68 
 
 		 126 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  58.4 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 		 136 aa  147  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  61.11 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  58.87 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  58.06 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  61.16 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  62.1 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  52.8 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 124 aa  130  9e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  50 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  52.89 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  51.56 
 
 		 227 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  50.41 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  49.6 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  52 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  50 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  50 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  48.31 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  49.6 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  49.18 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  47.9 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  47.58 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  51.64 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  48.74 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1955  endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  49.6 
 
 		 130 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  46.03 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  47.2 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  46.22 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  44.92 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>