More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4261 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 122 aa  246  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  71.31 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  57.26 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 		 132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  50.78 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  50 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  50 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  52.54 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  53.39 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  51.56 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  48.78 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  47.06 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  49.22 
 
 		 227 aa  117  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  46.09 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 125 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  48.76 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  48.78 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  44.8 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  50.41 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  44.35 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  46.83 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  46.03 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  43.09 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  44.26 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  45.24 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>