More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0254 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
130 aa  265  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  57.6 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  59.83 
 
 
126 aa  144  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 
131 aa  143  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 
140 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 
135 aa  140  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  54.03 
 
 
135 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  58.27 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  55.81 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 
128 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
128 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 
136 aa  136  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  54.4 
 
 
132 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 
126 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 
125 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
132 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
126 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  58.33 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  51.56 
 
 
127 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  53.49 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  54.03 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
123 aa  131  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  54.55 
 
 
126 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  54.69 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  54.26 
 
 
132 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 
126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  48.46 
 
 
132 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  54.7 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  51.56 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  48.84 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  52.03 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  55.74 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  55.74 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 
125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  51.18 
 
 
127 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  128  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  52.03 
 
 
127 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
125 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 
122 aa  127  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 
124 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
125 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  48.84 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  52.89 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  51.24 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  52.03 
 
 
128 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
127 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 
227 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
124 aa  124  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  124  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
127 aa  123  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
129 aa  123  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
127 aa  123  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  48 
 
 
129 aa  123  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  52.54 
 
 
128 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 
126 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  53.28 
 
 
124 aa  122  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
130 aa  123  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  45.74 
 
 
130 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 
134 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  44.96 
 
 
130 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  52.07 
 
 
126 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 
126 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 
126 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 
126 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  53.39 
 
 
126 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 
128 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
124 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>