More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0262 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  99.17 
 
 
120 aa  239  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  95.83 
 
 
120 aa  234  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  80 
 
 
120 aa  203  5e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  63.79 
 
 
131 aa  158  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  58.77 
 
 
126 aa  142  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 
126 aa  137  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  59.83 
 
 
144 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  55.17 
 
 
136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 
125 aa  131  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  56.41 
 
 
121 aa  130  5e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  53.45 
 
 
124 aa  130  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  53.98 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  57.52 
 
 
125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  54.31 
 
 
126 aa  127  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  56.64 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  57.02 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  55.75 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  53.57 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  54.87 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  53.51 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 
123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  51.33 
 
 
126 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  52.21 
 
 
126 aa  124  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  51.3 
 
 
148 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  50.85 
 
 
127 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 
140 aa  123  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 
125 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  54.87 
 
 
125 aa  123  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 
127 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  51.75 
 
 
128 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
143 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 
124 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  52.14 
 
 
126 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 
124 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  54.87 
 
 
126 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 
126 aa  121  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 
127 aa  121  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 
126 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 
126 aa  120  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 
126 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 
127 aa  120  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  53.45 
 
 
127 aa  120  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 
127 aa  120  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 
131 aa  120  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 
127 aa  119  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  54.87 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  50.88 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  50.88 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  50.88 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 
129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  49.11 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 
129 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 
127 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 
127 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 
127 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 
122 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 
124 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 
124 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 
124 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  49.14 
 
 
124 aa  116  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  49.14 
 
 
124 aa  116  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 
124 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 
128 aa  116  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  49.57 
 
 
127 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  46.49 
 
 
135 aa  115  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  51.33 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 
125 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 
125 aa  114  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 
127 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
127 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 
129 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 
126 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  46.22 
 
 
129 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  47.41 
 
 
124 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 
128 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>