More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002892 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  260  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  91.27 
 
 		 148 aa  244  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  76.98 
 
 		 126 aa  204  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  76.19 
 
 		 127 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  76.19 
 
 		 127 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  76.19 
 
 		 127 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  76.61 
 
 		 127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  75.4 
 
 		 127 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  75.81 
 
 		 127 aa  197  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  75 
 
 		 128 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  75 
 
 		 127 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  70.63 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  59.06 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 126 aa  157  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 125 aa  140  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  49.19 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  49.19 
 
 		 156 aa  130  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  51.61 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  48 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  52.17 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  50.43 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  51.3 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  47.29 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  47.29 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  46.51 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  46.51 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  49.19 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  45.53 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  46.15 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  44.96 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  48.74 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  44.62 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  45.38 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>