More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3922 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  249  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  70.16 
 
 		 126 aa  179  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  68.55 
 
 		 126 aa  177  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  65.08 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  64.23 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  65.04 
 
 		 125 aa  163  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  63.11 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  65.18 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  51.22 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  49.22 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  49.22 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  50 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  47.62 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  48.41 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  47.58 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 123 aa  120  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  46.28 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  45.67 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  47.24 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  47.24 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  45.67 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  45.67 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  45.67 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  45.67 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  45.67 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  45.67 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  45.67 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  45.24 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 127 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  115  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  47.86 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  43.8 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  43.8 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  46.77 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>