More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4710 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
125 aa  246  8e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  81.45 
 
 
126 aa  207  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  64.52 
 
 
126 aa  169  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  63.71 
 
 
126 aa  164  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  65.29 
 
 
125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  63.41 
 
 
125 aa  161  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  65.29 
 
 
125 aa  159  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  62.9 
 
 
126 aa  158  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 
126 aa  155  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 
126 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 
125 aa  131  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
124 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 
129 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
125 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
126 aa  128  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 
128 aa  127  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
124 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
124 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  48 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  47.54 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  47.54 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
124 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
124 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
126 aa  123  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  122  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
128 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 
127 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  47.54 
 
 
124 aa  121  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  48.74 
 
 
135 aa  121  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
129 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 
140 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
123 aa  121  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  40.8 
 
 
126 aa  120  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 
121 aa  120  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
131 aa  120  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  46.22 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  48.76 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
126 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  47.62 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 
129 aa  117  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  48.03 
 
 
128 aa  116  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 
129 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  49.57 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  46.96 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 
126 aa  114  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  46.83 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
127 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  43.8 
 
 
126 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
126 aa  114  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
128 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
128 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
128 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
128 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
128 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  48 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  48 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  47.2 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>