More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0419 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  247  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  74.6 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  75.4 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  72.36 
 
 		 125 aa  174  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  73.11 
 
 		 125 aa  173  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  65.08 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  65.85 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  63.39 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  58.54 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  50.41 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  47.11 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  49.6 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  49.19 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  49.19 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  46.56 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  50.82 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  46.34 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  49.19 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  45.04 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  51.33 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  47.62 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  45.04 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 124 aa  117  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  45.8 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 122 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  48.8 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  45.8 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  44.72 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>