More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0835 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
125 aa  246  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  77.42 
 
 
125 aa  194  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  68.55 
 
 
126 aa  176  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 
126 aa  166  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  64.23 
 
 
126 aa  165  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  65.04 
 
 
126 aa  164  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  65.85 
 
 
126 aa  159  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  61.79 
 
 
125 aa  156  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  65.18 
 
 
125 aa  148  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 
125 aa  130  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  47.97 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
126 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
126 aa  127  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
124 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
127 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
124 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 
126 aa  123  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 
127 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
124 aa  123  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  45.53 
 
 
128 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 
127 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  50.41 
 
 
135 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
124 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
123 aa  122  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  46.28 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  46.28 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
143 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
124 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  44.8 
 
 
148 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 
125 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 
128 aa  121  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  46.28 
 
 
127 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 
128 aa  121  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 
124 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  50.81 
 
 
125 aa  120  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
125 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  50.43 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 
126 aa  117  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 
127 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
124 aa  117  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 
126 aa  116  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 
124 aa  114  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
129 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  44.63 
 
 
124 aa  114  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  44.62 
 
 
129 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 
126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  45.97 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  43.85 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  42.28 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  43.9 
 
 
126 aa  111  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 
130 aa  111  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 
125 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  43.85 
 
 
129 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
127 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 
126 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  45.38 
 
 
129 aa  110  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 
126 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 
127 aa  110  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 
127 aa  110  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  43.41 
 
 
128 aa  110  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
130 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  43.08 
 
 
129 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>